Θέμα εθνικής κυριαρχίας τέθηκε ξαφνικά κατά τη σύνοδο κορυφής της Ε.Ε. στις Βρυξέλλες την Παρασκευή, από την απαίτηση του πρωθυπουργού της Τσεχίας ο πρωθυπουργός της Τσεχίας Πετρ Νέτσας προς τον πρωθυπουργό Αντώνη Σαμαρά να αφεθούν ελεύθεροι δύο Τσέχοι, οι Μάρτιν Πέζλαρ και Ιβάν Μπούχτα, που είχαν συλληφθεί στις 9 Σεπτεμβρίου για κατασκοπεία στην Λήμνο και στην κατοχή τους είχε βρεθεί πλούσιο οπτικό υλικό από τις περισσότερες στρατιωτικές εγκαταστάσεις του νησιού, μεταξύ των οποίων και των επάκτιων πυραυλικών συστημάτων MM-40 Exocet στο Μούδρο!
Ο πρωθυπουργός της Τσεχίας σε μία απειλητική για την Ελλάδα προσέγγιση του όλου θέματος, ζήτησε από τον Α.Σαμαρά «να εξασφαλίσει ότι οι ελληνικές αρχές θα δώσουν προσοχή στο θέμα, προκειμένου να αποφευχθεί οποιαδήποτε παρεξήγηση που θα μπορούσε να βλάψει τις διμερείς σχέσεις» εννοώντας ότι αν δεν αφεθούν ελεύθεροι οι δύο κατηγορούμενοι για κατασκοπεία,